Die ersten dokumentierten Ernten des Weinguts gehen auf das Jahr 1252 zurück, unter dem Namen Domaine de la Mothe in Pessac. Im Jahr 1299 geht die Liegenschaft an Gaillard de Goth über, dessen Bruder Bertrand gerade zum Erzbischof von Bordeaux ernannt worden war — ein Amt, das es ihm untersagte, selbst Käufer zu sein. Als Bertrand de Goth 1305 als Papst Clemens V. inthronisiert wird, erhält er das Weingut nach dem Tod seines Bruders 1306 und gibt ihm seinen endgültigen Namen. Clemens V., ein leidenschaftlicher Weinbauer, trägt aktiv zur Entwicklung der Rebe im Rhônetal und rund um Avignon bei, bevor er 1314 stirbt und das Weingut dem Erzbistum Bordeaux vermacht.
Über mehr als vier Jahrhunderte bleibt der Weinberg im kirchlichen Besitz. Die Französische Revolution bricht diese Kontinuität 1789: Die Revolutionäre beschlagnahmen das Weingut und versteigern es 1791. Es geht dann in mehrere aufeinanderfolgend bürgerliche Bordelaiser Hände über, bevor es zu Beginn des 20. Jahrhunderts vom Agraringenieur Paul Montagne erworben wird, der seinen Ruf wiederherstellt. Das Weingut wird 1953 als Grand Cru Classé de Graves für den Rotwein klassifiziert, dann 1959 für den Weisswein — eine in der Appellation einmalige doppelte Anerkennung.
Die eigentliche moderne Renaissance beginnt 1983 mit der Übernahme durch Bernard Magrez, einen visionären Bordelaiser Unternehmer. Umgeben vom Önologen Michel Rolland erfindet er das Weingut neu: parzellenweise Vinifikation, Einzelbeerenauslese, Holztanks von 30 bis 70 hl, Teilgärung in Tontöpfen, Ausbau in 70 % neuen Barriques für 16 bis 18 Monate. Die Verbindung von Tradition — Tierzug, manuelle Sortierung — und Innovation — Drohnen, Traktor-Autosteuerung, öko-eingeschlossene Sprühverfahren — trägt Früchte: 2009 verleiht Robert Parker dem Weisswein 100/100; 2010 wiederholt er dies für den Rotwein. Pape-Clément tritt damit in den erlesenen Kreis der Bordelaiser Châteaux ein, die doppelt mit der Höchstnote ausgezeichnet wurden.
Der Zweitwein, Le Clémentin de Pape-Clément, in Rot und Weiss, teilt dasselbe Terroir und dasselbe Knowhow. Der Rotwein, vom Merlot (~70 %) mit Cabernet Franc dominiert, bietet sofortige Zugänglichkeit zu einem günstigeren Preis. Der Weisswein liefert die Frische des Sauvignon Blanc in einem mineralischen und präzisen Stil, zu geniessen in 5 bis 8 Jahren.
- 1252 Erste dokumentierte Ernten des Domaine de la Mothe in Pessac.
- 1305 Bertrand de Goth wird Papst Clemens V. Er erhält das Weingut 1306 und gibt ihm seinen Namen.
- 1314 Tod von Clemens V. Das Weingut wird dem Erzbistum Bordeaux für mehr als vier Jahrhunderte vermacht.
- 1789–1791 Französische Revolution: Beschlagnahme dann Versteigerung des Weinguts. Beginn einer Eigentümernachfolge.
- 1953 Klassifizierung Grand Cru Classé de Graves in Rot — offizielle Anerkennung der Rotweinqualität.
- 1959 Klassifizierung Grand Cru Classé de Graves in Weiss — Pape-Clément, einziges Château doppelt in Rot und Weiss klassifiziert.
- 1983 Bernard Magrez erwirbt das Château. Michel Rolland stösst zum Team. Radikale Transformation von Weinberg und Keller.
- 2003 Einweihung des neuen Barrique-Kellers. Renovation des Gärkellers mit Prestige-Tanks aus Eichenholz im Jahr 2007.
- 2009–2010 100/100 Robert Parker für den Weisswein 2009, dann für den Rotwein 2010. Internationale Krönung.

